20世纪以来，随着科学技术的发展，许多国家对蜂毒药理、毒理做了系统的研究，发现蜂毒具有抗炎、镇痛、抗菌、调节代谢、调整心律和免疫刺激作、抗辐射的药理作用，对人体多个系统的疾病具有治疗作用。
3.1 治疗风湿病及类风湿性关节炎

类风湿性关节炎是一种临床难以疗的疾病，迄今未有特效药，常规用药都只是缓解症状，不能根除疾病。蜂毒中的多肽具有抗炎作用，能降低毛细血管的通透性，抑制白细胞移行，抑制前列腺素E2的合成，并能促进肾上腺皮质激素分泌，临床上常用来治疗风湿性和类风湿性关节炎。王法祥等报告了1989~2001年应用蜂毒治疗的98例临床观察，他们发现临床治愈率65.7%，显效率20.2%，有效率10%，无效4.1%，总有效率95.9%。陈蜂毒治疗具有起效快、疗效可靠、耐受性好等特点。
3.2 治疗神经痛
蜂毒肽能够提高疼痛阈，降低疼痛的敏感性，具有较高的镇痛作用。临床用于三叉神经痛、坐骨神经痛、偏头痛等。
3.3 治疗高血压
蜂毒中的磷脂酶A2可明显增加血浆组织胺浓度，通过组胺的释放改变外周阻力，能降低血压。可用于治疗症状性高血压和高血压病，另外，蜂毒对于更年期症状性高血压有良好的疗效。而且对心肌炎、心律不齐、下肢静脉曲张、动脉粥样硬化等心血管疾病也有一定的疗效。
3.4 治疗肿瘤
蜂毒肽对人神经胶质瘤细胞具有明显的增殖抑制和促进凋亡作用。蜂毒素体外抑瘤作用的实验研究证明蜂毒素的体外抑瘤作用明显，而且作用发生迅速，而且蜂毒肽的镇痛作用对于癌症引发的疼痛有良好的疗效。王居祥等发现蜂毒注射液能稳定瘤体，抑制肿瘤生长，具有一定的抗癌作用，蜂毒注射液与化疗合用具有协同增效的趋势。
3.5 治疗带状疮疹
蜂毒中具有消炎镇痛作用，其中蜂毒肽能使病毒外壳具有渗透性，表现出一定的抗病毒作用；溶血毒多肽对G+、G-菌均有抑制和杀灭作用，能对带状疮疹继发细菌感染的预防和治疗有积极的作用；溶血毒多肽、神经毒多肽和MCD肽可引起皮质醇含量增加，能加快炎症的修复。
3.6 治疗肩周炎
蜂毒具有很强的抗炎镇痛，改善微循环的作用，蜂毒多肽能修复损伤神经，终止神经水肿和神经纤维脱髓鞘功能，促进神经纤维内冲动传达等作用。蜂毒触痛点封闭和锋针疗法围攻治疗能改善肩周炎局部疼痛、肿胀、功能障碍，使肩周炎获得好转。
3.7 支气管哮喘
王春利等利用蜂毒穴位超声中频导入治疗支气管哮喘48例，结果显效18例，占37.5%；有效25例，占52.1%；无效5例，占10.4%；总有效率为89.6%，临床未见毒副作用。
3.8 其它疾病
除以上疾病外，临床还报道有蜂毒用于颈椎病，腱鞘炎，强直性脊柱炎，肌筋膜炎，硬皮病，牙痛，鼻炎，乙型病毒性肝炎，肝硬化，胃痛，月经不调，乳腺增生，慢性盆腔炎等的治疗。