一般均在饭前1-1.5小时或饭后2-3小时食用比较适宜。但对有胃肠道疾病的患者，则应根据病情确定食用时间，以利于发挥其医疗作用。如在饭前一个半小时食用蜂蜜，它可抑制胃酸的分泌;如在食用蜂蜜后立即进食，它又会刺激胃酸的分泌;温热的蜂蜜水溶液能使得胃液稀释而降低胃液酸变，而冷的蜂蜜水溶液却可提高胃液酸多，并能刺激肠道的运动，有轻泻使用。因此，胃酸过多或肥大性胃炎、特别是胃和十二脂肠溃汤的患者，宜在饭前1小时半食用温蜂蜜水，不仅能抑制胃酸的分泌，而且能使胃酸降低，从而减少对胃粘膜的刺激，有利于溃疡面的愈合;而胃酸缺乏或萎缩性胃炎的患者，宜食用冷蜜水后立即进食。神经衰弱者在每天睡觉前食用蜂蜜，可以促进睡眠，因为蜂蜜有安神益智和改善睡眠的作用。

蜂蜜含有丰富的镁，能调节心理、消除紧张、减轻压力，对女性很有帮助。同时它富含B族维生素，具有舒缓安眠的作用，因此建议女性可以在睡前饮用。当然，睡前30-60分钟饮用一杯蜂蜜水，也不是人人适合的。其原因是此时饮用蜂蜜水，由于饮用后会使血糖快速提升，所以中老年人、血脂异常者还是选用白开水更为适宜。
在最好的时候喝蜂蜜，也要控制好每天喝蜂蜜的量。作为治疗或辅助治疗，成人一天100克，不要超过200克，分早、中、晚三次服用，儿童食用量为30克最好，但应视年龄大小而定。用于治疗，以两个月为一个疗程;作为保健服用量可酌情降低，一般每天10～50克。