蜂蜜有吸收异味、吸湿及发酵等特性，如果贮藏不善，极易变质。为了保证蜂蜜在贮藏中的质量，应注意以下几点
 
按不同蜜源分别贮藏：
不同蜜源的蜂蜜，颜色、香味、滋味都不相同，应分装贮藏以防蜂蜜混杂而降低质量。
保持蜂蜜的洁净：
刚生产后的蜂蜜常有花粉块、蜡片、蜂翅、蜂脚、灰砂、蜂尸等杂质，可将该蜂蜜盛入较高的大桶内，在温度较高、干燥的室内静置沉淀。沉淀所需时间视具体温度而定，一般在20℃时需3天，35℃时只需10小时，除去杂质后再贮存。
避免发酵：
蜂蜜内常有酵母菌存在，当温度、湿度适宜时，酵母菌便会生长繁殖，导致蜂蜜变酸，影响品质。水分含量较高的蜂蜜应盛人大口容器内，敞开放在干燥、通风、温度在25℃以上的室内，静置数天，蒸发多余的水分，完成后熟后再贮存。
防吸收水分和异味：
蜂蜜若保存不当，会吸湿而发酵。蜂蜜最好用密封性好的瓷器盛装，置于干燥、通风的室内，贮藏最适温度是5一10℃或27℃以上。若容器不能密封，贮藏室内绝不可同时存放带有强烈气味的物品，以防蜂蜜吸收异味。
防蜂蜜结晶：
瓶袋包装的蜂蜜，要保持外观透明，流质，须防止蜂蜜结晶，可用双层锅加热处理。处理时外层装水，内层装蜜，待蜜蜂温度达71℃时，保持数分钟，然后去火，静置一天，撇去表面泡沫，装入经过消毒的玻璃瓶中，严密封盖即可阻止结晶。