特种蜂蜜是指蜜蜂从特别稀有或珍贵特有的蜜源植物上采集酿造的具有不同特点的天然蜂蜜，特别受人青睐。研究表明，由于蜂蜜来自各种不同的蜜源植物，其成分和功能也并非完全一样。
保加利亚食疗专家认为，就各类蜂蜜对疾病治疗而言，一般来说，取决于蜜源植物的疗效，而不是蜂蜜本身，比如维生素缺乏者宜服薄荷花蜜，心血管和精神病患者宜服熏衣草花蜜，等等。因为蜂蜜品质不同，适应症也有差别，所以只有对症用蜜才有明显疗效。

新西兰科研人员对麦卢卡蜂蜜(麦卢卡属桃金娘科植物)的研究证明，这种蜜的主要特点是具有特别强的抗菌性，在较低浓度下(5%)就有很强的抗幽门螺旋杆菌的作用，其他蜂蜜无法与之相比，因为在这种蜜中已发现几种新的抗菌成分：3，5二甲氧基-4-羟基苯甲酸(丁香酸)、3，5一二甲氧基-4-羟基苯甲酸甲酯、3，4，5-三甲基苯甲酸以及2-羟基-3-苯丙酸。这些成分不仅对引起脓肿、败血症等的金黄色葡萄球菌有明显的抗菌活性，而且对引起消化性溃疡的幽门螺旋杆菌有特效。因此，在新西兰已将麦卢卡蜂蜜用于临床治疗消化性溃疡，并成为著名的特种蜂蜜。
我国的蜜源植物品种繁多，资源丰富，蜂蜜的药理作用与其蜜源植物的化学成分密切相关，一些含有特定有效成分的植物花蜜酿成的蜂蜜，往往具有独特的医疗保健功效。如半枫荷(又叫半荷枫，学名：树参，五加科)根、茎、叶均可入药，具有驱风祛湿、活血散瘀、消肿止痛等功效，是治疗风湿、痹痛、腰肌劳损、跌打损伤淤积肿痛和产后风瘫的特效药物之一，其所含有的有效成分使半枫荷蜜也具有类似的功效。
枇杷具有止咳化痰，开脾胃，止呕，解暑气，解渴等功效，是治疗咳嗽痰多、气喘、胃热呕吐的良药，其所含的有效成分使枇杷蜜也具有类似的功效。据吴树生(1997)用中蜂枇杷蜜治感冒、支气管炎、肺炎、高血压等病375例，均收到很好的疗效。

椴树蜜同椴树花一样，含有挥发油及半倍萜脂类醇，也就是使蜂蜜具有特殊香味的麝子油醇，具有镇静与防腐作用，临床应用于镇静、止咳安眠、解痉、支气管炎等;刺槐蜜含有刺槐甙和挥发油，具有抗菌止咳等作用;黄连蜜有泻火燥湿，清肝明目，厚肠止痢的作用;党参蜜有补中益气，润肺生津，补脾养胃的作用;荞麦蜜有补血益气之功，适用治贫血症、高血压、防治中风;益母草蜜有活血调经，降血压，利尿消肿的作用。总之，开发具有独特医疗保健价值和独特风味的特种蜂蜜，可以满足消费者的不同需求。